本单位中医人员编制36人，其中在编医生21人，具有高级技术人员13人（正主任医师4人，副主任医师9人），主治医师5人，住院医师3人，护士11人，技术人员4人。五十年代，北大医院建立中医科、针灸科；70年代建立了中医病房，80年代建立了中医研究室，且80年代成为国内最早的中西医结合临床硕士、博士培养和授予点。1987年成立中西医结合研究所。目前的中医科室由门诊（中医、中西医结合和针灸门诊）、病房和研究室组成。日门诊量约500人次以上，设有肾脏、消化、内分泌、心血管、皮科等多个专业特色门诊；在中医寒热辨证本质的研究、中医名词术语英译标准化的研究、五子衍宗丸抗衰老的临床及机理、中药抗消化性溃疡复发等研究领域属于国内领先水平；对消化、肾脏、糖尿病等疾病的中医、中西医结合治疗具有特色，近年来，开展了多项中医外治法如冬病夏治、中药帖敷治疗，自主研发的院内中药如清热化湿颗粒、清肺化痰颗粒、益肾凉血颗粒、益肾生发颗粒等16种制剂获得患者的青睐。多次获医院医疗先进和服务奖，尤其2003年获得医院抗击非典先进集体称号及北京大学抗击SARS先进工会小组称号。2006年获得中国中西医结合学会科学技术三等奖和北京市科学技术三等奖。2007年获得国家教委科学技术二等奖和中国中西医结合学会科学技术三等奖。