哈尔滨市儿童医院眼科创建于1980年末。1989年，国家为加强儿童弱视、斜视预防及治疗工作，市卫生局决定以我院眼科为主组建“哈尔滨市儿童斜视、弱视防治中心”。科室在工作中不断进取、壮大，建科二十余年，接待儿童眼病患者数十万人次，积累了丰富的儿童眼病的诊断、治疗经验，成为黑龙江省唯一具有儿童特色的小儿眼病专科。对儿童屈光不正（近视、远视、散光）的矫正、及斜视、弱视的治疗均与国际同步，对新生儿泪囊炎等的治疗处于国内、省内领先水平。2000年以来，医院加大对眼科的投入力度，进一步推进了科室硬件建设和学科发展。现有眼科综合验光台、自动验光仪、非接触性眼压仪、镜片检测仪等一大批现代化的检查、检测仪器，不仅为患儿提供了更加方便、快捷服务，许多不能配合的低龄儿童都得到了及时的检查及治疗，大大提前了屈光不正、斜视、弱视等儿童眼病的诊断、治疗时间，为广大患儿得到更好的视力恢复做出了积极的贡献。近几年来，年均门诊量近30000人次，完成斜视、先天性白内障、眼部肿物、眼部先天性畸形等各类手术近千例。哈尔滨市儿童医院眼科技术力量雄厚，现有医生7名，其中：主任医师2名，副主任医师1名，主治医师3名，住院医师1名；护士4名，均为副主任护师；多名业务骨干先后到北京、天津、美国等地进修学习，进一步提高了科室的整体诊断及治疗水平。近5年来，全科共撰写论文40余篇，编写论著2部；承担哈尔滨市科学技术局青年科学基金项目1项，《儿童应用两种睫状肌麻痹剂验光结果比较》获哈尔滨市科技成果，《泪道探通术治疗新生儿粘液性囊肿的时机选择》获哈尔滨市卫生局新技术引进应用奖。