医院重点科室，在诊治胃肠道、肝、胆、胰等疾病方面具有独到之处。科室拥有进口电子胃镜、电子结肠镜、十二指肠镜等一系列先进设备，除开展常规药物治疗外，还积极开展内镜下的治疗工作。胃肠镜检查，包括无痛胃肠镜检查。三年来已行胃肠镜检查治疗六千余例，效果好，无不良反应。引进AG9800氩气高频电刀，开展胃肠息肉，胃平滑肌瘤电切、电凝治疗术。1.食道静脉曲张的硬化剂治疗及橡皮套扎治疗。2.食管、贲门、幽门、胆道及结肠狭窄的记忆合金支架治疗。3.利用氩气刀、钛夹、药物进行上消化道出血内镜下止血治疗。4.消化道内异物内镜取出治疗。5.逆行性胰胆管造影术、乳头肌切开胆总管取石术。6.鼻胆管引流治疗胆总管结石、胆道残余结石、胆管癌及梗阻性黄疸。7.内镜下治疗化脓性胆管炎、重症坏死性胰腺炎。