空军总医院普通外科位于医院新建住院大楼八层，目前有高级技术职称医师7人，空军高层次科技人才3人，博士3人，硕士5人。普通外科包括胃肠、甲状腺、乳腺、周围血管、疝、肛门直肠外科等专业。胃肠外科以肿瘤外科为重点。开展了直肠癌各种保留肛门手术，如直肠癌双吻合法低位前切除术、早期直肠癌微创根治切除术等，近几年直肠癌保肛手术占全部直肠癌的50％以上，提高了患者的生存质量。采用吻合器进行经腹全胃切除，避免了开胸手术之虞，并发症较少。采用直线型切割缝合器进行右半结肠切除术，避免了术中污染，明显缩短了手术时间。遗传性胃肠道肿瘤（HNPCC、PJS、FAP等）是科室研究重点之一。近10余年来，科室收集了遗传性非息肉病性大肠癌（HNPCC）22个家系90余例病人，Peutz-Jeghers症（PJS，又称黑斑息肉病）60余例病人，都是国内较多的一组。科室对上述疾病进行了认真的临床和基础研究，在疾病的诊断、手术治疗、手术配合小肠镜等内镜治疗等方面具有独到的经验，取得了较好效果。发表相关学术论文30余篇、获得了军队医疗成果奖一项。对家族腺瘤性息肉病（FAP）进行了全结肠直肠切除、回肠肛门吻合术，取得了良好效果。乳腺外科专业开展了乳癌的新辅助化疗、放疗。乳癌的保乳手术，术后乳腺外形保持不变，配合放疗、化疗等综合治疗，达到了与传统根治手术相似的治疗效果。对各种乳腺手术特别讲究切口的选择和缝合，使切口美观、隐蔽、瘢痕小，受到女性患者的好评。甲状腺外科开展了甲状腺癌的改良颈清扫术，创伤小，外形好，效果好。在甲状腺手术的切口缝合上，特别注意切口的美观，采用较小的切口和美容缝合，术后切口瘢痕小，外形美观，受到患者的欢迎。近3年开展了手术治疗慢性肾功能衰竭合并继发性甲旁亢，取得了较好效果。采用疝修复材料进行无张力疝修补手术，目前已完成2000余例，该手术特别适用于中、老年人疝、巨大疝及复发疝，术后疼痛明显减轻，疝复发率较传统手术明显下降。血管外科以周围血管外科为重点，开展腔镜下交通支结扎术（SEPS）适于因交通支瓣膜功能不全所致的下肢溃疡，以代替传统的筋膜下交通支结扎术，显示了其微创的特点，越来越受到推广。肛肠外科专业除采用传统手术方式外，还引进了德国ASECULAP带冷光源肛门直肠微创手术器械。开展了PPH手术(严重脱垂环状内痔切除)，获得空军总医院创新技术奖一项。空军总医院普通外科在科主任和党支部的领导下，热情为广大伤病员服务，工作作风严谨，医德医风好，近5年来医院综合管理质量评分均在前3名，受到患者和家属的好评。