北京佑安医院于1988年在国内传染病医院率先成立消化专业组，在病毒性肝炎患者人群中开展消化内镜检查与治疗工作。1993年正式成立肝病消化科。2000年经北京市卫生局批准，成立北京市肝病内镜诊疗中心，肝病消化科是医院重点科室之一，是首都医科大学硕士研究生培养基地。2006年被评为全院先进科室。消化内镜中心现占有面积达100多平方米，检查操作室2个，拥有当前全球最先进的现代化大型电子内镜，以及进口胃肠电图，PH检测仪等先进诊疗设备，总投资达500万元。目前设备条件已达到或超过国内三级甲等综合医院先进水平。