南京口腔医院口腔颌面外科始建于1958年，是全国最早成立的专科之一，创办了省内第一个口腔颌面外科病房。经过50年的建设与发展，目前该科已成为集医、教、研为一体的省级重点临床专科科室，江苏省135重点建设学科。该科下设口腔颌面外科门诊、颌面头颈肿瘤病区、颌面整形病区、种植牙中心和整形美容科、耳鼻咽喉科等二级科室，同时还设有口腔颌面外科研究室和口腔颌面外科教研室。目前拥有牙科综合治疗椅25张，病床90张。科室现有医师32名，其中主任医师5名，副主任医师16名，博士5名，硕士10名。被江苏省卫生厅授予口腔颌面外科医师进修基地及江苏省口腔住院医师培训基地。南京口腔医院口腔颌面外科门诊设有齿槽外科、种植牙中心、整形美容中心、颞下颌关节病和三叉神经门诊、冷冻和激光门诊、耳鼻咽喉头颈外科门诊等。病房主要开展口腔颌面部各类严重感染，外伤，口腔颌面头颈部肿瘤，涎腺疾病，颞下颌关节病，先天性唇、面、腭裂，牙颌面畸形以及后天获得性畸形和缺损等疾病的诊治及耳鼻咽喉疾病。外阜住院病人占住院病人总数47.2%。科室具有较强的科研能力，目前在研课题项目11项，其中参与国家973课题1项，省级课题3项，市级课题7项。与南京大学生命科学院和化学化工学院合作的采用转基因技术将骨形成蛋白之cDNA转导到自体细胞修复骨缺损的研究达到国际先进水平。