南京军区总医院康复医学科成立于1930年秋，当时为中央医院之电疗科。历经抗日战争，至1946年为物理治疗科。1954年11月成立理疗科。1986年医院整编，理疗科更名为康复医学科。更名后科里陆续购置了全套康复治疗设施，如骨关节肌肉训练器、平行杠、训练阶梯、肋木架等训练器材，并新增添了肌电生物反馈仪、中风康复仪、电脑中频仪、热空气等先进的理疗仪器。近年来又新添了质量精良及先进的理疗仪器，如低周波、微波、短波及中谱治疗仪。南京军区总医院康复医学科除完成日常工作外，科主任和部分医师还在军内外组织的各种学习班授课。特别是1994年军区医高专在本院举办为期两年的康复理疗大专班，我科承担了大部分授课任务。近年来我科多次参加本专业的全国继续教育学习班讲课。在人才培养上，康复医学科从军内外引进多层次人才，对在职人员坚持走出去的原则。十多年来，康复医学科相继派医技师前往北京中国康复研究中心、WHO在武汉同济医科大学举办的康复医师训练班和在安徽医科大学举办的康复治疗师训练班、西安第四军医大学学习、培训和进修。南京军区总医院依托综合大医院的优势，与临床各科室密切配合，走理疗康复特色之路。目前，康复医学科对中枢神经和周围神经损伤、骨关节疾病、感染及外伤创面等疾患开展了卓有成效的康复治疗。如近8年来该科共收治中枢性偏瘫160例，有效率达90%，其中有4例特重型脑外伤患者经治疗后生活均能自理；治疗周围神经性面瘫近400例，痊愈率达98%。自1986年以来康复医学科的科研项目：1、音频电流在活家兔皮肤进行不同剂量电流的观察。2、有关考的松支流电导的实验研究3、急性乳腺炎的理疗观察。4、我国七十年物理学与康复中文文献情况分析研究。5、超短波对IgA肾病伴扁桃炎的激发试验。6、挛缩膝关节髌韧带轴间压力—应变关系的实验研究。7、膝关节制动对髌韧带力学特性影响的实验研究。8、磁带式音乐电疗仪改进为光驱式音乐电疗仪的原理及治疗周围神经性面瘫的疗效分析。9早期康复训练对急性脑缺血患者的经颅超声Doppler和脑电图的影响。近17年以来全科共发表论文55篇，其中被核心期刊录用37篇；翻译本专业论文并刊在国外医学（物理医学与康复）杂志和激光杂志上22篇；参写论著1部；参编论著2部；获军队科技进步三等奖1项；南京市优秀论文1项；医院医疗成果三等奖1项。