广东省中医院肛肠科成立于1956年，是广东省最早开展肛肠业务的专科，经过几十年的建设，在痔疮、肛瘘等肛门病的诊治方面积累了丰富的经验，以疗效显著在省港澳和东南亚地区享有盛誉。1992年与日本著名肛肠医疗集团高野会共建“大肠肛门病防治研究中心”，通过强强合作，使中心的医疗设备得到全面更新，达到全国一流水平，是广东省中医药学会肛肠专业委员会所在地。中心现有专科病床45张，诊疗手段齐备，可开展电子胃肠镜、肛管直肠压力测定、盆底肌电图、排粪造影、结肠运输试验、大肠水疗、大肠癌介入治疗等多种专科检查治疗。广东省中医院肛肠科诊治范围包括了肛门疾病、大肠肿瘤、大肠功能性疾病(顽固性便秘)和大肠炎性疾病等各种大肠肛门疾病，解决疑难疾病的能力较强。