解放军昆明总医院病理科创建于1954年，随着医院的发展不断成长壮大，现已成为集医疗、教学、科研为一体、设备先进、功能完善、人才集中的现代化科室，在医院整体医疗质量建设、人才培养和科学研究中发挥着重要的作用。全科有工作人员16人，其中医生8人、技术人员7人、卫生员1人，有博士4人，硕士1人。科主任杨举伦博士曾留学美国，是第三军医大学和昆明医学院兼职教授、云南省中青年学术和技术带头人后备人才、博士生导师，现担任中国病理学工作者委员会副主任委员、国家科技奖励评审委员、全军病理专业委员会常务委员、秘书长、成都军区医学科委会委员、病理专业委员会主任委员、云南省病理学会主任委员、云南省自然科学基金评审专家、《中华病理学杂志》特约编委、《诊断病理学杂志》编委、《临床与实验病理学杂志》编委、《西南国防医药》编委等学术职务。病理科下设制片室、免疫组化室、图像分析室、细胞病理室、分子病理实验室、肿瘤药敏实验室和四个诊断室。配备shandon全自动脱水机、包埋机、恒冷式冰冻切片机、巨检工作台、包埋盒打号机、细胞离心涂片机、LEICA染色片封片一体化工作站、石蜡切片机、冰冻切片机、MACRO石蜡切片机、OLYMPUS研究显微镜等进口设备，2004年投入110万元建立了分子病理实验室，现在全科设备总价值已达到500万元。病理科的主要工作是为院内外提供病理诊断服务，全科每年接收活检病理标本6000余例，脱落细胞学病理标本3000余例，还接受来自省内外的病理会诊；除开展了特殊染色、免疫组化、原位杂交、图像分析、薄层液基细胞学检查、电镜检查等与病理检查有关的业务外，还利用科内设备和人才优势开展了肿瘤药敏试验、CIK细胞培养等与临床治疗有关的新业务新技术；同时还向院内外提供科研服务。该科十分重视科学研究，已建成了肿瘤病理研究技术平台，具备了科技攻关的能力。近年来主要开展肿瘤早期诊断和发病机制研究。已在国家统计源期刊以上杂志发表论文100余篇，获得云南省科技进步一等奖1项、三等奖4项、军队科技进步三等奖3项。现有在研基金课题3项，研究经费共131万元。该科现在是第三军医大学病理学与病理生理学专业硕士生和博士生联合培养点、昆明医学院病理学与病理生理学专业硕士生联合培养点，从2000年起招收培养病理研究生，现有在读研究生8人。另外还接收来自军内外的病理进修生。