早在70年代，儿科就设立血液肿瘤专业，在蔡若莲，沈亦逵等主任带领下，在国内率先开展地中海贫血筛查和白血病、淋巴瘤等临床科研工作，对血液肿瘤性疾病积累了丰富的临床经验，为血液肿瘤患儿提供高水平的医疗服务。为满足不断日益增多患者需要，根据医院部署，儿童血液肿瘤专业于2009从儿科分出，单独建立血液肿瘤儿童病区（肿瘤内三科），在国内为少数，在广东为第一家独立设科的综合性医院。同时病房迁至宽敞明亮、洁静，优雅的惠福分院，主要为2人或3人一间，有效预防交叉感染，为患儿提供一个优良、舒适的就医环境。依托我院综合性医院优势，对儿童急性白血病普遍开展融合基因检查，白血病免疫分型，荧光原位杂交及残瘤白血病的检测等，为白血病的个体化治疗及治疗方案的及时变迁提供了坚实的基础。对其他儿童恶性实体肿瘤，提倡多学科综合治疗，充分发挥综合性医院优势，联合外科、病理科、医学影像学科、放疗科等对新诊断病例，进行讨论并制定详细的治疗方案和随访计划。2002年起独立开展异基因造血干细胞和自体造血干细胞移植临床工作，疗效显着，积累了一定临床经验。知识的不断更新和新技术的应用，使得儿童恶性血液肿瘤性疾病预后明显改善，患者明显增多，据2009年5月广东儿科学年会统计资料显示，我科为近5年来广州地区收治儿童急性淋巴细胞白血病患儿最多的单位，平均住院天数9天，为广东省内最短，临床诊疗技术处于国内先进水平。不断吸取国内外先进经验，依据国内儿童体质特点，按危险度分型制定白血病儿童个体化治疗方案。如采用改良BFM方案治疗儿童急性淋巴细胞白血病长期无病存活率达75%-80%左右。儿童急性髓性白血病达50%左右，肾母细胞瘤达70-93%,这些都为国内先进水平。他们中最长达20多年，与正常人一样工作、学习和生活，有的已考入大学，或已孕育正常后代。