三明市第二医院肾内科是医院的重点特色专科。为三明市肾脏病研究所挂靠科室。经过几代人不懈努力，已发展成为三明市规模最大、设备最齐全的特色专科。科室由肾病专科病房、血液净化中心、肾脏病实验室等三部分组成。专科病房设置病床20张，副主任医师1名、主治医师2名、住院医师3名，其中医学硕士2名。