2007年4月23日，创建于1953年的省邮电医院移交南方医科大学更名为南方医科大学第三附属医院(简称“南医三院”)，同时成立由中国工程院院士钟世镇和中国科学院院士姚开泰领头的硕士、博士生导师等近40人组成“专家技术指导委员会”实施技术指导。

　　2008年6月19日，南方医科大学在我院成立骨科研究所，钟世镇院士担任名誉所长， 中国著名骨科专家、中华医学会骨科学分会副主任委员金大地教授任所长、“南医三院”院长，同时从南方医院、珠江医院抽调大量骨干“空降”我院，提升我院医疗、教学、科研的综合实力，目前我院学科设置齐全,医师系列硕士以上学历达61.8%，能开展各种大、中型手术及微创手术，拥有先进的磁共振成像系统、螺旋CT、彩色B超、高频乳腺X光机、胸/腹腔镜系统、关节镜、椎管镜系统、癫痫刀治疗仪、电子胃肠镜、体外碎石机、动态心电、动态血压、平板运动及遥测心电监护仪等，在新建五百张床位的现代化住院大楼设骨科床位三百张，计划五年内把我院打造成国内一流，以骨科为特色的三级甲等综合医院。

　　我院骨外科系高等院校重点学科，脊柱外科为省医学重点专科、南方医科大学重点学科，硕士、博士学位授予点、博士后流动站。骨外科分脊柱、关节、创伤和骨病四个专业组。金院长在国内、港、澳及东南亚享有盛誉，学科技术力量雄厚，拥有正副教授4人，讲师7人，在读博士后、博士、硕士研究生20余人。骨科研究所与国际创伤、矫形外科学会、华裔骨科学会、国际椎间关节成形学会以及美、英、德等国著名大学有合作关系，每年互派学者进行学术交流。研究方向：脊柱功能重建、脊柱畸形矫治、微创脊柱外科、四肢脊柱创伤的救治、骨与关节软骨修复、生物材料及脊柱内植入物研制等。

　　科研成果：获国际基金2项，国家自然科学基金7项，军队及广东省科研基金18项。获军队科技进步一等奖1项；解放军总后勤部”十五”重大科技进步奖、军队医疗成果一等奖各1项，广东省科技进步一等奖1项，军队医疗成果二等奖2项，广东省及军队科技进步二等奖各2项。

　　妇产科擅长妇科常见病、疑难杂症、恶性肿瘤的综合治疗，不孕不育的诊治成功率高，微创手术、无痛人流、无痛分娩等已经成为特色。普外科开展“三甲”医院普外的所有手术，擅长微创行胆囊、肝囊肿、阑尾等切除术，特点是损伤小、出血少、恢复快、疤痕少。泌尿外科拥有先进的微创设备治疗泌尿系结石、前列腺增生症、女性尿失禁、泌尿系肿瘤等。

　　胸外科常规开展肺癌根治、食道癌根治，电视胸腔镜下各类胸部疾病的诊断及手术治疗，是广州市肿瘤氩氦刀治疗中心等。拥有氩氦刀治疗各种肿瘤是我院特色之一。神经外科以南方医院专家团队为主组建神经外科，可以开展三级甲等医院神经外科的所有技术。尤其在颅脑损伤的综合救治和脑肿瘤的显微外科治疗具有明显优势。康复科拥有省内最具特色的“国际麦肯基力学诊疗法”，治疗颈肩腰腿痛，疗效好，无创伤。体检科创建于1988年，是广东省最早成立的体检中心之一,多次被评为“广州地区百姓最信赖的健康体检中心”。

　　医院座落在广州市中山大道西天河公园北面，邮电技术学院旁，占地面积23000平方米，建筑面积达6万多平方米，环境优雅、宁静、舒适，住院大楼设施先进。是广州市城镇职工医疗保险定点医疗机构、广州市生育保险定点医疗机构、广州市工伤保险定点医疗机构、广东省社会工伤保险指定医疗机构、广东省直公费医疗定点挂钩单位、广州市公费医疗定点挂钩单位、广州市天河区公费医疗定点挂钩单位、广州市开发区公费医疗定点挂钩单位、广州市荔湾区公费医疗定点挂钩单位、黄埔区公费医疗定点挂钩单位、从化市城镇职工医疗保险定点医疗机构、中山市社会医疗保险定点医疗机构、增城市社会医疗保险定点医疗机构、广州市120急救网络医院、广州第16届亚运会定点医院、医保“AAA”信用等级医疗机构，多次被授予全省卫生系统行业作风建设先进集体、广东省直属机关文明单位等荣誉称号，为广东省政府行风评议满意医院。